武蔵野線の209-500系は2010年に京葉線へのE233-5000系の導入により京葉線から3編成が転用され登場しました。
その後は中央・総武線へのホーム柵の導入による車両更新が必要となり山手線で使用されていたE231-500系を中央・総武線への転用で補う事となり、その余剰となった209-500系及びE231系を205系の置き換え用として武蔵野線への転用が行われました。
同車は武蔵野線への転用に際し編成短縮化の改造が行われ、あわせてラインカラーも同線のオレンジ・白・セピアの3色に改められました。
同車は最終的に2019年までに11編成が武蔵野線に導入されました。
運用範囲は武蔵野線（府中本町〜西船橋間）と京葉線（西船橋〜海浜幕張・東京間）のほか東北本線や中央線に直通する快速しもうさ号（海浜幕張〜大宮間）、快速むさしの号（大宮〜八王子間）でも活躍中です。